Inferência ONNX no Spark

ONNX (Open Neural Network Exchange) fornece um tempo de execução portátil e otimizado para hardware para modelos de aprendizagem automática. Ao converter um modelo para formato ONNX, pode executar inferência em lote no Spark com menor latência e sem depender do framework de treino original no momento da previsão.

Neste artigo, treina um modelo LightGBM com SynapseML, converte-o para o formato ONNX e depois usa o modelo ONNX para realizar inferência no Spark no Microsoft Fabric.

Pré-requisitos

  • Ligue o seu bloco de notas a uma casa no lago. No lado esquerdo do seu caderno, selecione Adicionar para adicionar uma casa de lago existente ou criar uma.
  • Fabric Runtime 1.2 ou posterior.

Instalar pacotes necessários

Execute a célula seguinte no seu portátil para instalar os pacotes necessários. O pacote onnxmltools não está pré-instalado no tempo de execução Fabric.

%pip install onnxmltools --quiet

Após a instalação concluída, verifique se os pacotes estão disponíveis:

import onnxmltools
import lightgbm
print(f"onnxmltools version: {onnxmltools.__version__}")
print(f"lightgbm version: {lightgbm.__version__}")

Note

O pacote lightgbm está pré-instalado em Fabric Runtime 1.2 e posteriores. Só precisa de instalar onnxmltools.

Carregue os dados de exemplo

Carregue o conjunto de dados de previsão de falências a partir do Armazenamento de Blobs do Azure público:

df = (
    spark.read.format("csv")
    .option("header", True)
    .option("inferSchema", True)
    .load(
        "wasbs://publicwasb@mmlspark.blob.core.windows.net/company_bankruptcy_prediction_data.csv"
    )
)

print(f"Rows: {df.count()}, Columns: {len(df.columns)}")
display(df.limit(5))

A tabela apresentada inclui colunas como:

Falido? Bandeira de Lucro Líquido Equivalência Patrimonial a Passivo
0 1.0 0.0165
0 1.0 0.0208

Treine um modelo LightGBM

Use o VectorAssembler para combinar colunas de características, depois treine um LightGBMClassifier:

from pyspark.ml.feature import VectorAssembler
from synapse.ml.lightgbm import LightGBMClassifier

feature_cols = df.columns[1:]
featurizer = VectorAssembler(inputCols=feature_cols, outputCol="features")

train_data = featurizer.transform(df)["Bankrupt?", "features"]

model = (
    LightGBMClassifier(featuresCol="features", labelCol="Bankrupt?")
    .setDataTransferMode("bulk")
    .setEarlyStoppingRound(300)
    .setLambdaL1(0.5)
    .setNumIterations(1000)
    .setNumThreads(-1)
    .setMaxDeltaStep(0.5)
    .setNumLeaves(31)
    .setMaxDepth(-1)
    .setBaggingFraction(0.7)
    .setFeatureFraction(0.7)
    .setBaggingFreq(2)
    .setObjective("binary")
    .setIsUnbalance(True)
    .setMinSumHessianInLeaf(20)
    .setMinGainToSplit(0.01)
)

model = model.fit(train_data)

Verifique se o modelo foi treinado com sucesso:

print(f"Model type: {type(model).__name__}")
print(f"Number of features: {len(feature_cols)}")

Converter o modelo para o formato ONNX

Exporta o modelo treinado para um booster LightGBM e depois converte-o para ONNX:

import lightgbm as lgb
from typing import Union
from lightgbm import Booster, LGBMClassifier
from onnxmltools.convert import convert_lightgbm
from onnxmltools.convert.common.data_types import FloatTensorType


def convert_to_onnx(lgbm_model: Union[LGBMClassifier, Booster], input_size: int) -> bytes:
    initial_types = [("input", FloatTensorType([-1, input_size]))]
    onnx_model = convert_lightgbm(
        lgbm_model, initial_types=initial_types, target_opset=13
    )
    return onnx_model.SerializeToString()


booster_model_str = model.getLightGBMBooster().modelStr().get()
booster = lgb.Booster(model_str=booster_model_str)
model_payload_ml = convert_to_onnx(booster, len(feature_cols))

Verifique se a conversão ONNX foi bem-sucedida:

print(f"ONNX model payload size: {len(model_payload_ml)} bytes")
assert len(model_payload_ml) > 0, "ONNX conversion failed: empty payload"

A saída mostra o tamanho da carga útil do modelo ONNX em bytes (tipicamente cerca de 800.000 bytes).

Importante

Use from onnxmltools.convert.common.data_types import FloatTensorType para a definição do tipo. O caminho from onnxconverter_common.data_types import FloatTensorType de importação mais antigo é incompatível com as versões atuais de onnxmltools.

Carregar e configurar o modelo ONNX

Carregue a carga útil ONNX num SynapseML ONNXModel e inspecione as entradas e saídas do modelo:

from synapse.ml.onnx import ONNXModel

onnx_ml = ONNXModel().setModelPayload(model_payload_ml)

print("Model inputs:" + str(onnx_ml.getModelInputs()))
print("Model outputs:" + str(onnx_ml.getModelOutputs()))

A saída lista os nós de entrada e saída do modelo.

Configure o modelo mapeando as colunas de entrada e saída. O FeedDict associa os nomes de entrada do modelo ONNX aos nomes de colunas do DataFrame. O FetchDict associa os nomes das colunas de saída pretendidas aos nomes de saída do modelo ONNX:

onnx_ml = (
    onnx_ml.setDeviceType("CPU")
    .setFeedDict({"input": "features"})
    .setFetchDict({"probability": "probabilities", "prediction": "label"})
    .setMiniBatchSize(5000)
)

Executar inferência

Crie dados de teste e transforme-os através do modelo ONNX:

from pyspark.ml.feature import VectorAssembler
import pandas as pd
import numpy as np

n = 10000
m = 95
test = np.random.rand(n, m)
testPdf = pd.DataFrame(test)
cols = list(map(str, testPdf.columns))
testDf = spark.createDataFrame(testPdf)
testDf = testDf.repartition(4)
testDf = (
    VectorAssembler()
    .setInputCols(cols)
    .setOutputCol("features")
    .transform(testDf)
    .drop(*cols)
    .cache()
)

display(onnx_ml.transform(testDf))

Note

Como os dados do teste são gerados aleatoriamente, os valores de previsão não representam resultados do mundo real. Esta secção demonstra que o modelo ONNX corre corretamente no Spark.

A saída deve conter colunas para features, prediction, e probability:

Caraterísticas predição probabilidade
{"type":1,"values":[0.105... 0 {"0":0.835...
{"type":1,"values":[0.814... 0 {"0":0.658...

Verifique os resultados da inferência produzida:

results = onnx_ml.transform(testDf)
print(f"Result count: {results.count()}")
print(f"Output columns: {results.columns}")
assert "prediction" in results.columns, "Missing prediction column"
assert "probability" in results.columns, "Missing probability column"

A saída confirma que todas as linhas de teste foram classificadas e o DataFrame de resultados contém as colunas features, prediction e probability.

Troubleshooting

Problema Motivo Resolução
ModuleNotFoundError: No module named 'onnxmltools' O pacote não está pré-instalado no runtime do Fabric. Executa %pip install onnxmltools --quiet e reinicia o kernel Python.
RuntimeError: Operator LgbmClassifier got an input with a wrong type Caminho de importação errado para FloatTensorType. Use from onnxmltools.convert.common.data_types import FloatTensorType em vez de importar de onnxconverter_common.data_types.
ModuleNotFoundError: No module named 'onnx.mapping' Versão 1.7.0 ou anterior de onnxmltools incompatível com o pacote atual onnx. Executa %pip install onnxmltools --upgrade --quiet para instalar uma versão compatível.
ONNX conversion returns empty payload A extração da corda do modelo booster falhou. Verifique se model.getLightGBMBooster().modelStr().get() devolve uma cadeia de caracteres não vazia antes da conversão.
Feature (Column_) appears more than one time durante model.fit() As colunas de um conjunto de dados com caracteres especiais produzem nomes duplicados após a normalização do LightGBM. Acrescenta .setDataTransferMode("bulk") à LightGBMClassifier configuração. O modo em lote utiliza Apache Arrow e evita o problema da normalização dos nomes das colunas.
AssertionError no SparkContext em ONNXModel() A sessão do Spark não está inicializada. Executa este código num caderno Fabric com uma casa de lago anexada. A spark variável é pré-inicializada pelo tempo de execução.

Limpeza de recursos

Se já não precisar do DataFrame de teste em cache, remova-o da cache para libertar memória do cluster:

testDf.unpersist()